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蛋白組學(xué)ITRAQ_TMT技術(shù)

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2023-03-09 03:26:41    作者:李晨曦    瀏覽次數(shù):176
導(dǎo)讀

1、實(shí)驗(yàn)介紹同位素標(biāo)記相對(duì)和可能嗎?定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技術(shù)由AB SCIEX公司研發(fā)得一種體外同種同位素標(biāo)記得相對(duì)與可能嗎?定量技術(shù)。該技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán),經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間得蛋白表達(dá)量,是

1、實(shí)驗(yàn)介紹

同位素標(biāo)記相對(duì)和可能嗎?定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技術(shù)由AB SCIEX公司研發(fā)得一種體外同種同位素標(biāo)記得相對(duì)與可能嗎?定量技術(shù)。該技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán),經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間得蛋白表達(dá)量,是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用得高通量篩選技術(shù)。

2、實(shí)驗(yàn)步驟:

2.1樣品準(zhǔn)備:將待測(cè)樣品進(jìn)行定量計(jì)算出樣品蛋白濃度;

2.2蛋白還原烷基化及酶解:每組樣品各取100μg按照iTRAQ試劑盒要求進(jìn)行處理,使用測(cè)序級(jí)胰蛋白酶溶液酶解后,超濾管離心收集酶解肽段;

2.3 iTRAQ標(biāo)記:將ITRAQ試劑平衡到室溫,用150μL異丙醇溶解,取酶解肽段加入iTRAQ試劑后室溫反應(yīng)2 h,加入水終止反應(yīng),等量混合不同組樣品,真空冷凍干燥樣品: .

2.4 LC-MS-MS分析:使用Thermo得Q-Exactive Orbitrap進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜鑒定。

2.5數(shù)據(jù)處理及生信分析

3、iTRAQ、TMT技術(shù)優(yōu)勢(shì):

3.1同時(shí)對(duì)2-8種不同條件樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)差異分析;

3.2不會(huì)破壞所測(cè)定得蛋白質(zhì);

3.3適合樣品類型多:胞漿蛋白、膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白等;

3.4與凝膠分離得蛋白質(zhì)定量技術(shù)相比,iTRAQ質(zhì)譜定量技術(shù)可檢測(cè)到更多類型得蛋白質(zhì)分子,如低豐度蛋白質(zhì)、強(qiáng)酸(堿)性蛋白質(zhì)、<10KD或>100KD得蛋白質(zhì)分子;高通量,可一次實(shí)驗(yàn),實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品得蛋白質(zhì)定性定量;

3.5標(biāo)記完全,標(biāo)記效率高達(dá)97%以上;

3.6幾乎兼容所有近日得樣本;

3.7定量敏感,反應(yīng)速度快,實(shí)驗(yàn)周期短。

4、常見樣品類型

5、示例圖

ITRAQ標(biāo)記譜圖

蛋白互作圖

 
(文/李晨曦)
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本文為李晨曦原創(chuàng)作品?作者: 李晨曦。歡迎轉(zhuǎn)載,轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明原文出處:http://nyqrr.cn/qysx/show-140119.html 。本文僅代表作者個(gè)人觀點(diǎn),本站未對(duì)其內(nèi)容進(jìn)行核實(shí),請(qǐng)讀者僅做參考,如若文中涉及有違公德、觸犯法律的內(nèi)容,一經(jīng)發(fā)現(xiàn),立即刪除,作者需自行承擔(dān)相應(yīng)責(zé)任。涉及到版權(quán)或其他問題,請(qǐng)及時(shí)聯(lián)系我們郵件:weilaitui@qq.com。
 

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