1、實(shí)驗(yàn)介紹
同位素標(biāo)記相對(duì)和可能嗎?定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技術(shù)由AB SCIEX公司研發(fā)得一種體外同種同位素標(biāo)記得相對(duì)與可能嗎?定量技術(shù)。該技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán),經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間得蛋白表達(dá)量,是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用得高通量篩選技術(shù)。
2、實(shí)驗(yàn)步驟:
2.1樣品準(zhǔn)備:將待測(cè)樣品進(jìn)行定量計(jì)算出樣品蛋白濃度;
2.2蛋白還原烷基化及酶解:每組樣品各取100μg按照iTRAQ試劑盒要求進(jìn)行處理,使用測(cè)序級(jí)胰蛋白酶溶液酶解后,超濾管離心收集酶解肽段;
2.3 iTRAQ標(biāo)記:將ITRAQ試劑平衡到室溫,用150μL異丙醇溶解,取酶解肽段加入iTRAQ試劑后室溫反應(yīng)2 h,加入水終止反應(yīng),等量混合不同組樣品,真空冷凍干燥樣品: .
2.4 LC-MS-MS分析:使用Thermo得Q-Exactive Orbitrap進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜鑒定。
2.5數(shù)據(jù)處理及生信分析
3、iTRAQ、TMT技術(shù)優(yōu)勢(shì):
3.1同時(shí)對(duì)2-8種不同條件樣品進(jìn)行蛋白質(zhì)差異分析;
3.2不會(huì)破壞所測(cè)定得蛋白質(zhì);
3.3適合樣品類型多:胞漿蛋白、膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白等;
3.4與凝膠分離得蛋白質(zhì)定量技術(shù)相比,iTRAQ質(zhì)譜定量技術(shù)可檢測(cè)到更多類型得蛋白質(zhì)分子,如低豐度蛋白質(zhì)、強(qiáng)酸(堿)性蛋白質(zhì)、<10KD或>100KD得蛋白質(zhì)分子;高通量,可一次實(shí)驗(yàn),實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品得蛋白質(zhì)定性定量;
3.5標(biāo)記完全,標(biāo)記效率高達(dá)97%以上;
3.6幾乎兼容所有近日得樣本;
3.7定量敏感,反應(yīng)速度快,實(shí)驗(yàn)周期短。
4、常見樣品類型
5、示例圖
ITRAQ標(biāo)記譜圖
蛋白互作圖